Melalui pindaan Undang-Undang Dasar Republik Indonesia 1945 yang memungkinkan presiden dipilih secara langsung oleh rakyat, beliau telah dipilih menjadi Presiden Republik Indonesia pertama pilihan rakyat serta presiden Indonesia keenam selepas dilantik pada 20 Oktober 2004 bersama Naib Presiden Jusuf Kalla. Beliau menewaskan pasangan Presiden Megawati Sukarnoputri-Hasyim Muzadi dalam pilihan raya umum 2004.

Pentadbiran SBY memberikan keutamaan kepada maslaah Pakatan sulit, Rasuah, dan Nepotisme (KKN), selain daripada masalah terorisme sejagat. Masalah narkotik, perjudian, dan perdagangan manusia juga diberikan tumpuan. Gelombang tsunami di Aceh dan Sumatera Utara yang terjadi pada 26 Disember 2004 menyebabkan pengorbanan dan menimbulkan rasa empati daripada pelbagai pihak di seluruh dunia.

Kabinet

Potret presiden rasmi Yudhoyono pada penggal pertamanya, diambil pada tahun 2004.

Pada hari perasmiannya pada tahun 2004, Yudhoyono mengumumkan kabinet barunya, yang akan dikenali sebagai Kabinet Indonesia Bersatu. Terdiri dari 36 menteri, termasuk anggota Partai Demokrat, Golkar dan PPP, PBB, PKB, PAN, PKP, dan PKS. Profesional juga dinamakan di dalam kabinet, kebanyakan mereka mengambil kementerian dalam bidang ekonomi. Tentera juga termasuk, dengan lima bekas anggota yang dilantik ke kabinet. Seperti yang dijanjikan Yudhoyono semasa pilihan raya, empat calon yang dilantik adalah wanita.[16]

Kabinet Bersatu Indonesia II Yudhoyono diumumkan pada Oktober 2009 selepas beliau dipilih semula sebagai presiden awal tahun ini. Naib Presiden Kabinet kedua Yudhoyono ialah Dr. Boediono. Boediono menggantikan Jusuf Kalla yang menjadi naib presiden dalam kabinet Yudhoyono yang pertama.

Pilihan raya presiden telah diadakan di Indonesia pada 8 Julai 2009. Presiden Susilo Bambang Yudhoyono memenangi lebih daripada 60% (60.08%) undi di pusingan pertama, yang memungkinkan dia untuk mendapatkan semula pemilihan tanpa larian. Yudhoyono secara rasminya diisytiharkan sebagai pemenang pemilihan pada 23 Julai 2009, oleh Suruhanjaya Pilihanraya Umum. Calon lain adalah Partai PDI-P Megawati Sukarnoputri 26.79%, Partai Golkar Jusuf Kalla 12,41%.

Ekonomi

Pada akhir 2007, Yudhoyono mengetuai Indonesia menjadi perjanjian perdagangan bebas dengan Jepun.[17]

Pendidikan dan kesihatan

Pada Julai 2005, Yudhoyono melancarkan program Bantuan Operasi Sekolah (BOS).[18] Di bawah aturan ini, kerajaan memberi wang kepada pengetua untuk membantu kewangan dalam menjalankan sekolah. Sekiranya BOS dapat menyediakan bantuan kewangan yang signifikan kepada sekolah maka sekolah diharapkan dapat menurunkan biaya atau, jika mereka mampu, untuk menghapuskan biaya sama sekali. Pada bulan Jun 2006, Yudhoyono melancarkan Buku BOS yang menyediakan dana untuk pembelian buku teks.[19]

Pada Januari 2005, Yudhoyono melancarkan Insurans Kesihatan Masyarakat Miskin (Askeskin). Askeskin adalah program yang diarahkan kepada orang miskin yang membolehkan mereka mengakses penjagaan kesihatan.[20]

Perkhidmatan pesanan ringkas Presiden

Sekitar bulan Jun 2005, Presiden SBY memulai perkhidmatan pesanan ringkas (SMS) ke nombor telefon bimbitnya di 0811109949. Namun pada hari keesokannya, terjadi gangguan teknikal kerana terlalu banyaknya SMS yang masuk. Sekarang, nombor itu digantikan dengan 9949 dan selepas itu, pesanan SMS akan disampaikan ke presiden. Nombor 9949 ialah tarikh lahir beliau (9 September 1949).

Pada 28 Jun 2005, Presiden SBY mengirimkan SMS kepada masyarakat Indonesia dengan nama pengirim "Presiden RI". Kebenaran pesanan itu yang berkaitan dengan pencegahan narkotik telah disahkan oleh jurucakap Presiden yang menyatakan bahawa berbagai-bagai SMS akan menyusul.

Keseimbangan kuasa dengan Naib Presiden Kalla

Walaupun beliau memenangi jawatan presiden, Yudhoyono masih lemah dalam parlimen Indonesia, Dewan Perwakilan Rakyat (DPR). Parti Demokrat, walaupun digabungkan dengan semua rakan gabungannya, mempunyai wakil yang jauh lebih sedikit daripada Golkar dan PDI-P, yang memainkan peranan pembangkang.

Dengan kongres kebangsaan yang akan diadakan pada Disember 2004, Yudhoyono dan Kalla pada mulanya telah menyokong pembesar Agung Laksono untuk menjadi pengerusi Golkar. Ketika Agung dianggap terlalu lemah untuk melawan Akbar, Yudhoyono dan Kalla melemparkan beban mereka di belakang Surya Paloh. Akhirnya, apabila Paloh dilihat terlalu lemah untuk menentang Akbar, Yudhoyono memberikan lampu hijau untuk Kalla untuk bertanding untuk Pengerusi Golkar.[21] Pada 19 Disember 2004, Kalla dipilih sebagai pengerusi baru Golkar.

Kemenangan Kalla menimbulkan dilema untuk Yudhoyono. Walaupun kini membolehkan Yudhoyono meluluskan undang-undang, kedudukan baru Kalla bermakna ia kini lebih kuat daripada Yudhoyono dari segi pengaruh di parlimen.

Selepas tsunami Lautan Hindi 2004, nampaknya atas inisiatifnya sendiri, para menteri yang berkumpul dan menandatangani perintah Naib Presiden memerintahkan kerja untuk memulihkan Aceh. Keaslian ketetapan Naib Presidennya dipersoalkan[22] walaupun Yudhoyono menyatakan bahawa beliau memberikan perintah untuk Kalla untuk meneruskan.

Pada September 2005, apabila Yudhoyono pergi ke New York untuk menghadiri Sidang Kemuncak Pertubuhan Bangsa-Bangsa Bersatu (PBB) tahunan, beliau meninggalkan Naib Presiden Kalla. Yudhoyono mengadakan persidangan video dari New York untuk menerima laporan dari menteri. Pengkritik menunjukkan bahawa ini adalah ekspresi ketidakpercayaan oleh Yudhoyono.[23] Cadangan itu seolah-olah mendapat momentum ketika Kalla hanya muncul untuk satu persidangan video dan kemudian menghabiskan masa lain untuk menjaga perkara-perkara Golkar.

Persaingan yang dikatakan muncul semula pada Oktober 2006 apabila Yudhoyono menubuhkan Unit Kerja Presiden untuk Organisasi Pembaharuan Program (UKP3R). Beliau menugaskannya dengan memperbaiki keadaan pelaburan perniagaan, melaksanakan diplomasi dan pentadbiran kerajaan, memperbaiki prestasi perusahaan milik negara, memperluas peranan perniagaan kecil dan sederhana, dan meningkatkan penguatkuasaan undang-undang secara keseluruhan.[24] UKP3R diketuai oleh Marsillam Simanjuntak, yang berkhidmat sebagai Peguam Negara ketika jawatan Presiden Wahid.

Pada Februari 2007, Yudhoyono menambah kebajikan kepada tugas UKP3R dengan memerintahkan mereka untuk memberi tumpuan kepada penghapusan kemiskinan, bantuan tunai langsung, perkhidmatan awam serta membantu program-program kesihatan dan pendidikan[25] Terdapat tuduhan bahawa ini adalah cubaan oleh Yudhoyono untuk mengecualikan Kalla daripada kerajaan. Yudhoyono cepat menjelaskan bahawa dalam mengawasi UKP3R, beliau akan dibantu oleh Kalla.[26]

Berurusan dengan Suharto

Pada 6 Mei 2005, Yudhoyono melawat Suharto di hospital ketika penderita mengalami pendarahan usus. Pada 5 Januari 2007, Yudhoyono dan isterinya melawat Suharto, yang kemudian dimasukkan ke hospital akibat anemia serta masalah jantung dan buah pinggang.[27][28] Selepas lawatan itu, Yudhoyono membuat rayuan kepada semua orang Indonesia untuk berdoa untuk pemulihan Suharto.[29]

Menjawab permintaan awam kepada Yudhoyono untuk memberi pengampunan kepada semua kesilapan Suharto yang lalu dalam memerintah negara itu, jurucakap presiden Andi Mallarangeng berkata, "Lawatan dari seorang presiden ke presiden yang dirawat di hospital adalah sesuatu yang normal. Menunjukkan kemanusiaan dan langkah undang-undang adalah dua perkara yang berbeza."[30]

Lain-lain

Yudhoyono bersama bekas presiden AS George W. Bush sewaktu menghadiri sidang kemuncak APEC pada 2004.Yudhoyono di dalam Senat poland pada 2013.

Pada 17 Ogos 2007, Indonesia dengan inisiatif Yudhoyono di Jakarta, mencadangkan bahawa lapan negara, rumah hingga 80% dari hutan hujan tropika di dunia bergabung dengan kedudukan diplomatik di tengah kekhuatiran yang semakin meningkat terhadap pemanasan global. Indonesia memimpin sidang lapan negara (pada 24 September di New York) - Brazil, Cameroon, Congo, Costa Rica, Gabon, Indonesia, Malaysia dan Papua New Guinea. Pada 3-15 Disember 2007, Indonesia menganjurkan Persidangan Pihak-Pihak ke-13 (COP-13) di bawah Konvensyen Rangka Kerja Pertubuhan Bangsa-Bangsa Bersatu mengenai Perubahan Iklim (UNFCCC) di Bali.[31]

Semasa kontroversi Islam Paus Benediktus XVI, Yudhoyono menyatakan bahawa komen Paus itu "tidak bijaksana dan tidak sesuai,"[32] Tetapi juga bahawa "umat Islam Indonesia harus mempunyai kebijaksanaan, kesabaran, dan pengawalan diri untuk menangani isu sensitif ini .... Kita memerlukan mereka supaya keharmonian di antara orang tidak dipertaruhkan."[33]

Yudhoyono adalah salah satu daripada 100 Orang Yang Paling Berpengaruh di Dunia pada tahun 2009 menurut majalah TIME.[34]

Semasa lawatan rasmi ke Australia, 9-11 Mac 2010, beliau telah dilantik sebagai Pesuruhjaya Kehormat Perintah Australia (AC)[35] dan ditujukan kepada Parlimen Australia, ketua negara Indonesia yang pertama yang berbuat demikian.[36]

Pasukan keselamatan Indonesia mendakwa telah membongkar plot untuk membunuh Yudhoyono. Satu mogok yang dikatakan berlaku pada 17 Ogos 2010, pada Hari Kemerdekaan Indonesia.[37]

Yudhoyono dianugerahkan Knight Grand Cross of the Order of the Bath (GCB) oleh HM Ratu Elizabeth II pada 30 Oktober 2012.[38]

Jawatan ketenteraan

• 1974-1976: Dan Tonpan Yonif Linud 330 Kostrad
• 1976-1977: Dan Tonpan Yonif 305 Kostrad
• 1977: Dan Tn Mo 81 Yonif Linud 330 Kostrad
• 1977-1978: Pasi-2/Ops Mabrigif Linud 17 Kujang I Kostrad
• 1979-1981: Dan Kipan Yonif Linud 330 Kostrad
• 1981-1982: Paban Muda Sops SUAD
• 1983-1985: Komandan Sekolah Pelatih Infantri
• 1986-1988: Dan Yonif 744 Dam IX/Udayana
• 1988: Paban Madyalat Sops Dam IX/Udayana
• 1989-1992: Pensyarah Seskoad
• 1993: Korspri Pangab
• 1993-1994: Dan Brigif Linud 17 Kujang 1 Kostrad
• 1994-1995: Asops Kodam Jaya
• 1995: Danrem 072/Pamungkas Kodam IV/Diponegoro
• November 1995 - : Ketua Pemerhati Tentera bagi Pengaman Pertubuhan Bangsa-Bangsa Bersatu (UNPF) di Bosnia-Herzegovina
• 1996: Kasdam Jaya (hanya lima bulan)
• 1996- Pangdam II/Sriwijaya merangkap Ketua Bakorstanasda
• 1998: Ketua Fraksi ABRI MPR (Persidangan Khas MPR 1998)
• 1998-1999: Ketua Staf Wilayah (Kaster ABRI)
• 26 Oktober 1999 - : Mentamben
• Menko Polsoskam (Pemerintahan Presiden Abdurrahman Wahid)
• Menko Polkam (Pemerintahan Presiden Megawati Sukarnoputri) mengundurkan diri 11 Mac 2004

Penugasan

• Operasi Timor Timur (1979-1980), dan 1986-1988

Parti politik

Semasa jawatan presidennya, Yudhoyono terus menyatukan kedudukannya dalam Partai Demokrat. Pada Mei 2005, pada Kongres Kebangsaan PD pertama, Yudhoyono dipilih sebagai Ketua Dewan Pembina.[39] Dalam jawatan ini, Yudhoyono mempunyai kuasa tertinggi, mengatasi pengerusi.

Pilihan raya umum 2014

Yudhoyono berdiri di sebelah penggantinya, Joko Widodo semasa pelantikannya, Oktober 2014.

Pada 27 Disember 2012, edisi harian The Jakarta Post membayangkan kemungkinan kerjasama dalam pemilihan umum tahun 2014 antara keluarga Yudhoyono dan bekas presiden Indonesia Megawati Sukarnoputri dan parti politik mereka, Parti Demokrat dan Partai Demokrasi Indonesia Perjuangan. [40] Perlembagaan Indonesia membatasi presiden kepada dua syarat jabatan, menjadikan Yudhoyono tidak layak untuk menjalankan jangka waktu ketiga.